发酵时间：45-60天
优质的有机肥料堆肥发酵过程一般需要45-60天的时间。这是因为在堆肥前期的升温阶段以及高温阶段会杀死植物致病病原菌、虫卵、杂草籽等有害微生物，但此过程中微生物的主要作用是新陈代谢、繁殖，而只产生很少量的代谢产物，这个过程有机肥堆肥需要45-60天。

发热阶段→高温阶段→降温阶段→腐熟保温阶段
有机肥堆肥的发酵过程简单可分为以下4个阶段
发热阶段
有机肥堆肥制作初期，堆肥中的微生物以中温、好气性的种类为主，最常见的是无芽孢细菌、芽孢细菌和霉菌。它们启动堆肥的发酵过程，在好气性条件下旺盛分解易分解有机物质（如简单糖类、淀粉、蛋白质等），产生大量的热，不断提高有机肥堆肥温度，从20℃左右上升至40℃，称为发热阶段，或中温阶段。

高温阶段
随着温度的提高，好热性的微生物逐渐取代中温性的种类而起主导作用，温度持续上升，一般在几天之内即达50℃以上，进入高温阶段。
在高温阶段，好热放线菌和好热真菌成为主要种类。它们对有机肥堆肥中复杂的有机物质（如纤维素、半纤维素、果胶物质等）进行强烈分解，热量积累，堆肥温度上升至60-70℃，甚至可高达80℃。



降温阶段
当高温阶段持续一定时间后，纤维素、半纤维素、果胶物质大部分已被分解，剩下很难分解的复杂成分（如木质素）和新形成的腐殖质，微生物的活动减弱，温度逐渐下降。当温度下降到40℃以下时，中温性微生物又成为优势种类。


腐熟保肥阶段
有机肥堆肥腐熟后，体积缩小，堆温下降至稍高于气温，这时应将有机肥堆肥压紧，造成厌气状态，使有机质矿化作用减弱，以利于保肥。
研究表明，在一定温度下加热一段时间可以破坏病原体、杂草种子。通常在60-70℃（湿热）的温度下，加热5-10min（分钟）。可以破坏非芽孢细菌和芽孢细菌的非休眠体的活性。利用加热灭菌，在70℃条件下加热30min（分钟）可以消灭污泥中的病原体。
但在较低温度下（50-60℃），一些病原菌的灭活则可长达60d。因此有机肥堆肥过程中保持60℃以上温度一段时间是必须的。在合理堆肥后残留的有机物分解率较低、相对稳定并易于被植物吸收。有机肥堆肥后臭味可以大大降低。
堆肥有机质的矿质化，可为作物和微生物提供速效养分，为微生物活动提供能源，并为有机肥堆肥有机质的腐殖化准备基本原料。

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