从古至今，它就在我国农业生产中都有着举足轻重的地位，虽然在化肥工业大发展时期稍有低谷，但随着绿色、优质、高效、健康、环保的新型农业的快速发展，有机肥料已再度受到青睐。

商品有机肥：是以畜禽粪便、动植物残体、生活垃圾等富含有机质的固体废弃物为主要原料，并添加一定量的其他辅料(如风化煤、草炭、中药渣、酒渣、菌菇渣等)和发酵菌剂，通过工厂化方式加工生产而成的肥料。

物理性质：土壤物理性状的好坏直接关系到土壤养分供给能力的大小。众多研究表明，施用有机肥料能改善土壤的物理性质，具体表现在长期施用可使土壤团粒结构增加、透气性增强、保水能力增强，土壤容重下降。

生物学性质：土壤微生物可以反映土壤中物质代谢的旺盛程度，是土壤肥力的一个重要指标。可以提高土壤酶活性，改善微生物的生存环境。

作物产量：可以提供作物生长发育所需的有机、无机养分，改善土壤环境，从而促进作物生长和提高产量。

秸秆类：常见的原有玉米秸秆、小麦秸秆、豆秸秆、水稻秸秆。含有高的纤维素和木质素等大分子物质，氮磷钾等养分含量较低(除豆科类)，单独用这类物料做有机肥的罕见，一般用来增加发酵物料的有机质，调节碳氮比。这类原料比较丰富，价格低廉，但因这些物料多存在农业从事散户手中，大面积收购比较困难，且季节性较强，全年生产需提前备货。

菌糠：俗称蘑菇渣、菌包，有金针菇渣、平菇渣、杏鲍菇渣等，原料多为酒糟、玉米芯、稻壳粉、麦麸、豆粕及配一些营养元素，菌糠有机质高、富含菌体蛋白、维生素、微量元素及生长素，做有机肥在肥力效果较好。

常见动物源性有机肥原料

动物加工废弃物：加工废弃物，甚至是养殖废弃物等也能成为有机肥的原料。但是须采用无公害生物降解法。

工业废弃物

烟末烟梗：此类物料有机质、养分、糖类都较高，在作为有机肥的主要原料的产品肥力效果好，还有抑制杂菌，抵抗土壤虫害的效果，价格也较低廉。

氨基酸渣：蛋白含量高，多在40%以上，多数有味道也多为湿料，价格中下等，需烘干和晾晒，味道较重，肥力效果好。

其它原料

城市污水沉淀的污泥：虽然含有一定量的有机质和氮磷钾成分，这类原料不用花钱，加工成本很低，但重金属和大肠杆菌严重超标，易引发死根、死树现象，果实人吃后易引发恶性癌变。

造纸厂的下脚料：这种肥料，主要成分是木质素。是极难吸收的一种有机质，何况在造纸的过程中要加进许多化学原料，而且这些原料绝大部分存留在下脚料里，它对土壤的破坏很大，对树根的影响很大。